Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms