Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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