Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IhhP97812 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IhhP97812 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IhhP97812 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms