Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms