Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms