Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
rp9P97762 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
rp9P97762 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
rp9P97762 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
rp9P97762 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
rp9P97762 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
rp9P97762 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
rp9P97762 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms