Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms