Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lig3P97386 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms