Protein–RNA interactions for Protein: P97300

Nptn, Neuroplastin, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NptnP97300 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NptnP97300 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NptnP97300 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NptnP97300 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NptnP97300 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NptnP97300 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NptnP97300 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms