Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43bP86448 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms