Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms