Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NyxP83503 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NyxP83503 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NyxP83503 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NyxP83503 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms