Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx1P81068 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms