Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms