Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms