Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms