Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad1P70340 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms