Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1P70338 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms