Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms