Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms