Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms