Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms