Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms