Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms