Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NficP70255 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NficP70255 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NficP70255 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NficP70255 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NficP70255 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NficP70255 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms