Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf6P70196 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms