Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrig1P70193 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms