Protein–RNA interactions for Protein: P70172

Slc10a2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a2P70172 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc10a2P70172 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc10a2P70172 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms