Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms