Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3P62908 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms