Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms