Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms