Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf1P61148 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms