Protein–RNA interactions for Protein: P60003

Elof1, Transcription elongation factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elof1P60003 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Elof1P60003 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Elof1P60003 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms