Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms