Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms