Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm2P58774 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms