Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms