Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms