Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtskP55097 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms