Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms