Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcanP55066 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcanP55066 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcanP55066 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcanP55066 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcanP55066 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcanP55066 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NcanP55066 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcanP55066 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms