Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PctpP53808 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PctpP53808 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms