Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fdft1P53798 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms