Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DbtP53395 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DbtP53395 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DbtP53395 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms