Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dbx1P52950 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms