Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApodP51910 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApodP51910 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApodP51910 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms