Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms