Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntfP51642 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntfP51642 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntfP51642 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntfP51642 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntfP51642 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfP51642 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CntfP51642 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms