Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa8P50706 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms